Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms