Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms