Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou1f1Q00286 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms