Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx3P81067 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx3P81067 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms