Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUP107P57740 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUP107P57740 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP107P57740 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP107P57740 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP107P57740 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP107P57740 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms