Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Fgf9P54130 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgf9P54130 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgf9P54130 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgf9P54130 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Fgf9P54130 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgf9P54130 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgf9P54130 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Fgf9P54130 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgf9P54130 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Fgf9P54130 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fgf9P54130 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Fgf9P54130 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fgf9P54130 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fgf9P54130 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fgf9P54130 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fgf9P54130 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fgf9P54130 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fgf9P54130 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fgf9P54130 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Fgf9P54130 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fgf9P54130 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fgf9P54130 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fgf9P54130 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Fgf9P54130 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fgf9P54130 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Fgf9P54130 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fgf9P54130 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Fgf9P54130 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Fgf9P54130 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Fgf9P54130 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Fgf9P54130 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Fgf9P54130 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgf9P54130 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgf9P54130 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgf9P54130 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgf9P54130 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgf9P54130 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgf9P54130 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgf9P54130 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgf9P54130 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Fgf9P54130 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Fgf9P54130 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms