Protein–RNA interactions for Protein: P42682

Txk, Tyrosine-protein kinase TXK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxkP42682 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TxkP42682 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TxkP42682 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TxkP42682 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TxkP42682 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TxkP42682 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TxkP42682 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TxkP42682 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TxkP42682 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TxkP42682 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TxkP42682 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TxkP42682 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TxkP42682 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TxkP42682 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TxkP42682 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TxkP42682 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TxkP42682 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TxkP42682 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms