Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms