Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk2P38575 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms