Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms