Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa4P28311 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa4P28311 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa4P28311 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa4P28311 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms