Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms