Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RargP18911 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RargP18911 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RargP18911 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RargP18911 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RargP18911 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RargP18911 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RargP18911 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RargP18911 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RargP18911 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RargP18911 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RargP18911 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RargP18911 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RargP18911 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RargP18911 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RargP18911 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RargP18911 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RargP18911 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RargP18911 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RargP18911 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms