Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc1bP0C7A0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc1bP0C7A0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.6 ms