Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TtrP07309 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TtrP07309 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TtrP07309 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtrP07309 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
TtrP07309 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TtrP07309 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TtrP07309 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TtrP07309 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms