Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04214 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04214 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04214 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04214 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04214 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P04214 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P04214 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P04214 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P04214 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P04214 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P04214 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P04214 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P04214 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P04214 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P04214 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P04214 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P04214 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P04214 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04214 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P04214 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms