Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt1P04104 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms