Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pgbd1E9Q492 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms