Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms