Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ38

Gm45062, Predicted gene 45062, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45062E0CZ38 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45062E0CZ38 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45062E0CZ38 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45062E0CZ38 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45062E0CZ38 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45062E0CZ38 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45062E0CZ38 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45062E0CZ38 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm45062E0CZ38 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms