Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms