Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 VOPP1-205ENST00000427700 632 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RPS28P8-201ENST00000435020 208 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL513318.1-201ENST00000437925 991 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC104695.1-201ENST00000439700 849 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC034238.2-201ENST00000445660 567 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL218P-201ENST00000464637 299 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC010307.4-202ENST00000507403 389 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC114812.3-201ENST00000509542 730 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 GNGT2-205ENST00000511673 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP197-201ENST00000517077 297 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02284-201ENST00000558120 573 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01620-205ENST00000637248 546 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AP000705.2-201ENST00000433524 1386 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CADPS-220ENST00000613879 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K8-202ENST00000375321 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PHACTR2-AS1-201ENST00000450575 1699 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINB12-201ENST00000269491 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP127-201ENST00000410443 354 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 ACTBP12-201ENST00000435871 418 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 DISC1-IT1-201ENST00000456782 762 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC9-AS1-203ENST00000457758 548 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL135P-201ENST00000490144 278 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms