Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms