Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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