Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACTBP60709 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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