Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PODXLO00592 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PODXLO00592 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PODXLO00592 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PODXLO00592 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PODXLO00592 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PODXLO00592 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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