Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IMPG1Q17R60 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms