Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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HOXD13P35453 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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