Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AC106774.10-201ENST00000638486 599 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HS6ST2-206ENST00000640529 831 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FAM41C-203ENST00000446136 1807 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ATP8B3-203ENST00000526092 2759 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PC-203ENST00000393960 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZNF557-202ENST00000414706 5736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A8-203ENST00000430500 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC104394.1-201ENST00000611658 1748 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 BABAM2-202ENST00000344773 1852 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HIVEP3-201ENST00000372583 12193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CAPN2-202ENST00000433674 3264 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GLA-201ENST00000218516 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZNF619-210ENST00000522736 2030 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC00484-205ENST00000423719 3023 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LY86-AS1-201ENST00000429345 1941 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC022596.2-201ENST00000635352 3078 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CFAP44-201ENST00000295868 3377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPKP1-201ENST00000510896 1379 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SLC6A15-201ENST00000266682 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FLJ31356-202ENST00000445878 3001 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TRMT10A-201ENST00000273962 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ENSA-202ENST00000339643 633 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC11B-201ENST00000382776 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC006509.2-201ENST00000419124 395 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC007563.1-201ENST00000434973 689 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HLA-DRB6-203ENST00000437650 715 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC013733.2-201ENST00000440371 635 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FXYD6P2-201ENST00000444174 288 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GLRA1-202ENST00000455880 1707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 BIN3-207ENST00000520292 775 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC025419.1-209ENST00000544557 854 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL525P-201ENST00000579267 280 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL509P-201ENST00000579670 297 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC024592.2-201ENST00000589276 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LSP1P1-201ENST00000599825 133 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CU633980.1-201ENST00000613894 1708 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 Z93929.2-201ENST00000615011 2623 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NOP16-208ENST00000616685 472 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC092902.2-220ENST00000626334 685 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC005906.2-209ENST00000639919 1244 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NMT1-201ENST00000258960 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ARMC8-217ENST00000481646 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC183088.1-201ENST00000626622 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NEUROD6-201ENST00000297142 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AP001178.3-201ENST00000585150 2106 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SERPINB7-201ENST00000336429 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC011095.1-201ENST00000584677 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZNF383-208ENST00000590503 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NT5C1B-202ENST00000359846 2475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZNF551-201ENST00000282296 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GDNF-201ENST00000326524 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 C17orf77-202ENST00000392620 2525 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 KBTBD12-204ENST00000407609 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MAMLD1-204ENST00000426613 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms