Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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HOXD13P35453 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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HOXD13P35453 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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HOXD13P35453 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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HOXD13P35453 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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