Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 EFCAB14P1-201ENST00000442409 463 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 KIF3AP1-201ENST00000454055 611 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 DCSTAMP-203ENST00000517991 949 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC02178-201ENST00000566876 425 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RBM22P13-201ENST00000569805 1244 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL136304.1-201ENST00000607790 509 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 EIF5P2-201ENST00000618904 1035 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GABRR3-202ENST00000472788 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL627309.5-203ENST00000466557 1301 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.4 ms