Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ZSCAN26-202ENST00000421553 2835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 CTNNA2-217ENST00000540488 2792 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 TARS-204ENST00000502553 2534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 ALDOB-201ENST00000374855 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 FRG2C-201ENST00000308062 2078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 ZNF345-202ENST00000420450 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 NXPE2-201ENST00000389586 1873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 SEMA4A-202ENST00000368282 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL591848.3-201ENST00000570141 2968 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 TCF7-202ENST00000378560 2929 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 SHC4-203ENST00000537958 1447 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 EDNRA-201ENST00000324300 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC012501.1-201ENST00000454312 555 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 IFNA22P-201ENST00000458710 570 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC034232.2-201ENST00000511579 917 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 STRIP1-201ENST00000369795 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 ATP1B2-201ENST00000250111 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 NTN4-202ENST00000344911 3152 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 CHEK1-213ENST00000532449 4051 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 N6AMT1-201ENST00000303775 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 CAMK2G-206ENST00000394762 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 LNP1-203ENST00000489752 1813 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC114689.1-201ENST00000578727 2484 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 KBTBD4-204ENST00000526005 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 FAT3-206ENST00000533797 7894 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 FAM86EP-201ENST00000313946 2845 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 GREB1L-209ENST00000580732 8749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 MAPK10-252ENST00000640970 2620 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 SNORD86-201ENST00000391196 86 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC116353.1-201ENST00000489727 316 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 RN7SL864P-201ENST00000493457 285 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms