Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LAMTOR5-AS1-205ENST00000587691 441 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC103974.2-201ENST00000611319 778 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CTSLP2-202ENST00000626319 1104 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 WDR11-AS1-207ENST00000630905 769 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CSNK2A3-201ENST00000528848 1416 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR10U1P-201ENST00000414690 905 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC012494.1-201ENST00000439259 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC092568.1-201ENST00000440950 1284 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL049820.1-201ENST00000442936 423 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TUBB4BP2-201ENST00000454125 798 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL520P-201ENST00000474110 286 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL12P5-201ENST00000475149 392 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 QTRT2-215ENST00000493014 1046 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms