Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U3KQE9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U3KQE9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U3KQE9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQE9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms