Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cib2Q9Z309 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib2Q9Z309 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms