Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms