Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA2Q9UL42 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms