Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmbr1Q9JIT0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms