Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms