Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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1700012A03RikQ9DAF1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700012A03RikQ9DAF1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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