Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms