Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms