Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1N2

Gpihbp1, Glycosylphosphatidylinositol-anchored high density lipoprotein-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpihbp1Q9D1N2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpihbp1Q9D1N2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpihbp1Q9D1N2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms