Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms