Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms