Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ergic3Q9CQE7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms