Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms