Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tlcd1Q99JT6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms