Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms