Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW7

Cd209e, CD209 antigen-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209eQ91ZW7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd209eQ91ZW7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd209eQ91ZW7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms